จัดตั้งตามวัตถุประสงค์ของคณะอนุกรรมการประเมินความเสี่ยงด้านความปลอดภัยอาหาร ภายใต้คณะกรรมการการอาหารแห่งชาติ ที่มีมติให้มีการศึกษาเพื่อเสนอจัดตั้งหน่วยงานประเมินความเสี่ยงด้านอาหาร โดยมีเป้าหมายหลักในการบริหารจัดการประเมินความเสี่ยงด้านอาหาร
มีระบบที่มีประสิทธิภาพ และการจัดทำฐานข้อมูลเครือข่ายของบุคลกรซึ่งมีความรู้ ความสามารถ สอดคล้องกับหลักสากล และรองรับกับสถานการณ์ด้านความปลอดภัยอาหารที่เปลี่ยนแปลงไปอย่างรวดเร็วจากปัจจัยทั้งในและต่างประเทศ